Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdnE9Q9K5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms