Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc146E9Q9F7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms