Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp31E9Q6Y8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms