Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FancfE9Q5Z5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FancfE9Q5Z5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms