Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trip11E9Q512 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip11E9Q512 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip11E9Q512 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms