Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930579F01RikE9Q3L6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms