Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Lrp3E9Q1T6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Lrp3E9Q1T6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Lrp3E9Q1T6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrp3E9Q1T6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms