Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms