Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chd2E9PZM4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd2E9PZM4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms