Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcom1E9PZ54 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms