Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp54bE9PXC0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp54bE9PXC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 370.7 ms