Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931408C20RikE9PWP9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931408C20RikE9PWP9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4931408C20RikE9PWP9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms