Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3298E9PW80 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm3298E9PW80 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm3298E9PW80 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3298E9PW80 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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