Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931429L15RikE9PVU2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms