Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc62E9PVD1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms