Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3bE9PUL3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms