Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl3E0CZ16 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl3E0CZ16 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms