Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn2r49D3Z6L3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r49D3Z6L3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms