Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
3425401B19RikD3Z1D3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.57■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.55■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.54■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms