Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm4871D3Z0W7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm4871D3Z0W7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms