Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldlrad1D3YYZ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ldlrad1D3YYZ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ldlrad1D3YYZ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms