Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc170D3YXL0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms