Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BC048679D3YXE9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms