Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo5D3YW29 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms