Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm4950D3YUM8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm4950D3YUM8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm4950D3YUM8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm4950D3YUM8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms