Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ube2d4D3YUH6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ube2d4D3YUH6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms