Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smok3bC0HKC9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smok3bC0HKC9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms