Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptprz1B9EKR1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptprz1B9EKR1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms