Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cspp1B2RX88 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms