Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Siah3B2RWG3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms