Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cfap58B2RW38 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cfap58B2RW38 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms