Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clrn2B2RVW2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clrn2B2RVW2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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