Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Abcc8B2RUS7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Abcc8B2RUS7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Abcc8B2RUS7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc8B2RUS7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms