Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apba1B2RUJ5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apba1B2RUJ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms