Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc22a28B2RT89 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc22a28B2RT89 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms