Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scn7aB1AYL1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scn7aB1AYL1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms