Protein–RNA interactions for Protein: B1AVM1

Gm12887, Predicted gene 12887, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12887B1AVM1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm12887B1AVM1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm12887B1AVM1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms