Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700084M14RikB1AT01 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700084M14RikB1AT01 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms