Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf39A2RT81 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms