Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Htra4A2RT60 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra4A2RT60 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms