Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl41A2AUC9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl41A2AUC9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms