Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabreA2AMW3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms