Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc183A2AJB1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms