Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem185aA2AF53 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem185aA2AF53 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms