Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpatch8A2A6A1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpatch8A2A6A1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpatch8A2A6A1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpatch8A2A6A1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpatch8A2A6A1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpatch8A2A6A1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gpatch8A2A6A1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gpatch8A2A6A1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gpatch8A2A6A1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms