Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cul4bA2A432 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cul4bA2A432 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cul4bA2A432 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cul4bA2A432 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cul4bA2A432 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul4bA2A432 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cul4bA2A432 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms