Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkd2l1A2A259 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms