Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2P7S8

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2P7S8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1W2P7S8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2P7S8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms