Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms