Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RNP2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms